我们实验室是一个专注于解析基因组中暗物质非编码RNA的生物信息学与系统生物学研究团队。我们实验室致力于通过干湿相结合的研究策略(一方面开发新型计算生物学方法及工具,另一方面开展生物学实验)对非编码RNA功能及作用机制进行系统性研究及应用转化,发现驱动胚胎干细胞命运决定及癌症发生发展的关键非编码RNA药靶标志物,筛选靶向关键非编码RNA的小分子及大分子药物。具体研究方向如下:
研究方向一:非编码RNA功能预测算法及数据库
利用系统生物学、网络生物学算法及机器学习技术,整合多层次组学数据,开发新型生物信息学工具在多种类型动植物中对非编码RNA的生物学功能进行系统性预测,发现与动植物表型相关的非编码RNA,构建非编码RNA功能预测平台及数据库。
研究方向二:关键非编码RNA的作用机制
与国内外相关课题组进行紧密合作,聚焦于利用干湿相结合的研究策略针对研究方向一中预测发现的调控干细胞多能性与全能性命运转变及癌症发生发展的关键非编码RNA,利用细胞生物学实验、分子生物学实验及高通量多组学测序开展功能验证及分子机制研究。
研究方向三:基于非编码RNA的新药研发
聚焦于研究方向二中发现的在重大复杂疾病发生发展过程中起关键作用的非编码RNA基因,通过大数据挖掘算法及工具,整合不同层面的生物医学大数据,搭建药物筛选预测系统,并与相关医院建立合作,通过临床试验将研究成果进行应用转化。